Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCLCP48506 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLCP48506 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLCP48506 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLCP48506 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms