Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME1P48163 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME1P48163 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ME1P48163 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ME1P48163 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME1P48163 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME1P48163 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME1P48163 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms