Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4P46934 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4P46934 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms