Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms