Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms