Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL35P42766 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms