Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms