Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF4A3P38919 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms