Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPB2P35606 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPB2P35606 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPB2P35606 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPB2P35606 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms