Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL9P32969 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL9P32969 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL9P32969 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL9P32969 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL9P32969 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL9P32969 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL9P32969 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL9P32969 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL9P32969 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL9P32969 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL9P32969 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL9P32969 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL9P32969 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms