Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms