Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms