Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms