Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNE1P24864 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms