Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
S100A1P23297 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
S100A1P23297 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
S100A1P23297 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
S100A1P23297 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
S100A1P23297 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms