Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCNA2P20248 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms