Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGCP20142 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGCP20142 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGCP20142 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGCP20142 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PGCP20142 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGCP20142 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGCP20142 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGCP20142 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGCP20142 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms