Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPA1P20036 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms