Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD53P19397 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD53P19397 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD53P19397 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD53P19397 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD53P19397 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD53P19397 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD53P19397 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD53P19397 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CD53P19397 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD53P19397 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms