Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2CP19387 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2CP19387 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms