Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XBP1P17861 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
XBP1P17861 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XBP1P17861 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XBP1P17861 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XBP1P17861 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XBP1P17861 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XBP1P17861 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XBP1P17861 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms