Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYN1P17600 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYN1P17600 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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