Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms