Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFAP15692 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms