Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSPT1P15170 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSPT1P15170 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms