Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM225BP0DP42 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms