Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM10L2BP0DMW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM10L2BP0DMW5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms