Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD3P0DMS9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms