Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C879 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C879 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P0C879 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P0C879 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms