Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms