Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP10P09238 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP10P09238 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP10P09238 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP10P09238 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP10P09238 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms