Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP3P08254 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP3P08254 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP3P08254 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP3P08254 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP3P08254 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP3P08254 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP3P08254 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms