Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK1P06493 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK1P06493 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK1P06493 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK1P06493 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK1P06493 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK1P06493 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms