Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYCNP04198 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYCNP04198 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYCNP04198 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYCNP04198 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYCNP04198 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYCNP04198 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYCNP04198 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYCNP04198 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYCNP04198 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms