Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC1P02654 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC1P02654 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms