Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSD2O96028 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSD2O96028 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSD2O96028 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSD2O96028 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSD2O96028 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSD2O96028 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms