Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX7O95931 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX7O95931 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX7O95931 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms