Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNTO95613 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNTO95613 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNTO95613 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms