Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDNEP1O95476 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDNEP1O95476 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDNEP1O95476 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTDNEP1O95476 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms