Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRATO95237 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRATO95237 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRATO95237 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LRATO95237 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LRATO95237 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LRATO95237 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRATO95237 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRATO95237 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms