Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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