Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPFIA4O75335 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA4O75335 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms