Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPHP4O75161 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPHP4O75161 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms