Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF40O75150 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF40O75150 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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