Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms