Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L1O43166 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1L1O43166 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms