Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLOCKO15516 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms