Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASKO14936 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASKO14936 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASKO14936 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASKO14936 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASKO14936 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASKO14936 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASKO14936 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms