Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EBAG9O00559 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms