Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms